Balkan Savaşları, I. Dünya Savaşı ve Milli Mücadeleye katılan Atilhan, Edirne Müdafaasında gösterdiği kahramanlık ve cesaretten dolayı Bulgarların bile takdirini kazanarak esir tutulduğu Soya'da kendisine "Bulgar İmtiyaz Madalyası" takdim edildi. Filistin-Suriye Cephesi'nde Mersinli Cemal Paşa'nın yaverliğinde, Birinci ve İkinci Gazze savaşlarına katılarak, İkinci Gazze savaşında İngiliz ordusuna karşı yaptığı taarruzla savaşın Türkler lehine gelişmesinde büyük rol oynadı. 1916'da Yahudiler tarafından kurulan ve Filistin Cephesinde İngilizlere istihbarat sağlayan NİLİ adlı casusluk teşkilatını deşifre ederek çökertilmesini sağladı. Bartın ve Havalisi Komutanlığına getirildi ve Fransızlara karşı mücadele etti. Savaştan sonra yüzbaşı rütbesiyle emekliye ayrıldı.

1933 yılında Nazi Almanyasını ziyaret ettiğinde, Hitler'le tanışarak 1934'de Münih'te toplanan Siyonist, Komünist ve Farmason Düşmanları Kongresinde kongrenin başkanlığını üstlendi. 1940'da İhtiyat subayı olarak görevli bulunduğu sırada, Nazilerce desteklenen hükümet darbesi yapacağı suçlamasıyla tutuklanıp, 11 aylık bir mahkumiyetin ardından beraat etti. 1948'de başlayan Arap-İsrail Savaşı'nda emekli Türk subaylarından oluşan 300 kişilik bir gönüllü birliğini Arap saflarında savaşmak üzere Filistin'e gönderdi. Demokratik hayatın ilk muhalefet partisi olan Milli Kalkınma Partisi'nin kuruculuğuyla başlayan siyasi hayata 1947'de Türk Muhafazakar Parti, Necip Fazıl Kısakürek'le Büyük Doğu Cemiyeti'nin genel başkan yardımcılığı ve 1951'de kurduğu İslam Demokrat Partisi'yle devam ederek, Türkiye'de İslamcı siyasetin mimarı oldu.